- tehotenstvo
- kardiostimulátor
- akútne ústne choroby
- zápal prínosových dutín
- kŕče
- krvácanie
- niektoré pľúcne choroby
- optická neuritída
- horúčka
- pneumotorax a hrudná chirurgia
Kyslíková terapia v hyperbarickej komore je bezpečný postup, avšak aj pri menej invazívnom postupe sa môžu vyskytnúť vedľajšie účinky ako napríklad bolesť hlavy, zvracanie alebo únava, ktoré sú výsledkom príliš vysokého tlaku používaného pri liečbe, alebo príliš dlhého času stráveného v hyperbarickej komore.